Na ja, von Basel Bad nach SBB kann man es auch drauf ankommen lassen. Da habe ich noch keine Kontrollen erlebt.
So habe ich es auch immer gemacht, allerdings sind meine Erfahrungen mindestens 10 Jahre alt. Bin da immer durchgefahren. Hatte geplant, mich im Kontrollfall auf dumm zu stellen ("warum? Ist doch dieselbe Stadt."). War aber nie nötig.
Auch letztes Jahr war es ohne Probleme möglich.
Wenn man aus dem Zug geworfen wird, dann geht es erst im Bahnhof SBB
Wobei eine durchgehende, internationale Fahrradkarte meist günstiger ist, als zwei nationale. Ähnliches gilt für den durchgehenden, deutschen Sparpreis.
Zum Buchen von Rädern bei der DB in grenzüberschreitenden Zügen: Bei Zügen, die die DB selber stellt, ist das für rein deutsche Strecken bei bahn.de möglich und bei vielen SBB oder ÖBB-Zügen auch. Es gibt aber auch Ausnahmen: Einen durchgehenden ÖBB-EC von Innsbruck über Bregenz nach Dortmund konnte ich ab Lindau nicht buchen. Der Schalter konnte es, konnte aber keinen Fahrradplatz einsehen oder gar auswählen, sondern nur "blind" verkaufen. Die ausgedruckte Reservierung enthielt dann eine Platznummer.